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DNA连接总翻车?6个隐藏buff让你一次成克隆!

DNA连接总翻车?6个隐藏buff让你一次成克隆!

Fri Jul 11 00:00:00 CST 2025毕合生物|MBC新闻编辑

有没有被连接反应虐到怀疑人生?载体自连、插入失踪、转化白板……



️温度玄学:25℃只是起点!

连接酶最适25℃,但平末端建议“两段式”:先室温10 min激活,再4℃过夜慢炖❄️。别小看这步,平末端效率能翻3倍!高温?直接让酶热到罢工。

摩尔比=成功密码

单片段插入记住“载体:插入=1:3~1:10”,超过1:10载体自闭给你看!小技巧:用Nanodrop算浓度别手抖,平末端可加少许切割酶防自连⚡。

浓度陷阱:太浓太稀都不行

总DNA 5-10 μg/mL是甜蜜点!举个栗子:50 μL体系里,载体+插入别超0.5 μg。平末端偷偷加0.1U载体酶,自连率直降80%!

缓冲液暗藏彩蛋

ATP 0.5-1 mM刚好,多了抑制反应!ATP缓冲液分装-20℃冻存,避免反复冻融。升级配方:加1 μL 0.1% BSA,酶活性稳如老狗。

️酶的选择:T4还是高保真?

T4 DNA连接酶万能选手,长片段/复杂结构换NEBuilder高保真,错误率低到0.1%!平末端救星:1 mM DTT+5% PEG-8000,效率飙升50%。

转化前必做:灭活内切酶!

热灭活65℃ 20 min(T4适用),或柱纯化/乙醇沉淀去残留酶活。终极杀招:连接产物跑胶回收,纯度99%+。

实战案例:平末端从20%→85%

原条件25℃ 1 h效率20%,优化后:载体:插入=1:5+5% PEG-8000+4℃过夜+65℃热灭活,转化子数量翻4倍!菌落PCR阳性率85%

连接反应配方(50 μL体系)

T4连接酶1U+10×缓冲液1×+载体50 ng+插入150 ng+PEG-8000 5%+ddH₂O补至50 μL,冰上操作别手抖!

⚠️避坑三连

❌ 反复冻融连接酶(活性暴跌!)
❌ 平末端用Taq产物(A尾干扰!)

❌ 感受态OD600>0.6(效率腰斩!)